تختلف أدوات البرمجة في هندسة الأنظمة الآلية اعتمادًا على اللغة البرمجية المستخدمة ونوع النظام الآلي الذي يتم تطويره. ومن بين الأدوات الشائعة في هذا المجال:
1. MATLAB / Simulink: برنامج MATLAB يُستخدم للحوسبة العلمية والهندسة، ويمكن استخدامه بشكل خاص في تصميم ومحاكاة نظم التحكم الآلي. يوفر برنامج Simulink واجهة بديهية لتصميم نماذج النظم الآلية.
2. LabVIEW: برنامج LabVIEW يستخدم لتصميم وتطوير أنظمة التحكم الآلي والأتمتة وتحليل البيانات. يتميز بواجهة مستخدم بسيطة وسهلة الاستخدام.
3. Python: لغة برمجة عالية المستوى يمكن استخدامها في تصميم وتطوير النظم الآلية. يتميز بسهولة الاستخدام وقابلية التوسع.
4. C / C ++: لغات البرمجة الأساسية التي يمكن استخدامها في تصميم النظم الآلية عالية الأداء والتحكم في الأجهزة والأتمتة.
5. ROS (Robot Operating System): نظام تشغيل الروبوتات الذي يستخدم لتصميم وتطوير الروبوتات والنظم الآلية الأخرى. يتميز بواجهة برمجة قياسية ومجموعة من الأدوات المتاحة للمطورين.