يوجد عدة عيوب قد تعرف على عملية الإنتاج الصناعي، ومن أهمها:
1- الإنتاجية المتغيرة: حيث يمكن أن تتأثر سرعة الإنتاج بعدد من العوامل مثل التثبيت في أجزاء المعدات أو تحديث النظم.
2- عدم الدقة: حيث أن العمليات الصناعية تحتاج إلى سيطرة ودقة كبيرة وحتى الجهات الصناعية الأكبر قد تواجه صعوبة في تحقيق هذه الدقة.
3- التكاليف العالية: حيث يتطلب استخدام المعدات والتقنيات الحديثة في عملية الإنتاج تكلفة عالية يمكن أن تعد عائقاً أمام العديد من المصنعين الصغار.
4- اعتمادية التكنولوجيا: حيث أن عملية الإنتاج الصناعي تعتمد بشكل كبير على التكنولوجيا ويمكن أن يتأثر الإنتاج بشكل كبير في حالة حدوث أي خلل في التكنولوجيا المستخدمة.
5- الضوضاء والتلوث: يمكن أن تتسبب عمليات الإنتاج الصناعي في إصدار الضوضاء والتلوث الذي يؤثر على البيئة المحيطة وصحة العاملين في المصنع.