يترتب على تصحر الأراضي ونقص الموارد المائية آثار سلبية كثيرة على البيئة، من أهمها:
1- تغيير المناخ: يتسبب تصحر الأراضي في زيادة درجات الحرارة لأن تدفق الطاقة الشمسية يزيد على الأراضي الصحراوية والجزئيات المتناثرة في الهواء.
2- انخفاض التنوع البيولوجي: يؤدي انخفاض المياه المتاحة إلى انخفاض عدد النباتات والحيوانات القادرة على العيش في المناطق الجافة.
3- تغيير المناظر الطبيعية: يتسبب تصحر الأراضي في تغيير المناظر الطبيعية من أراض خضراء إلى أراض صحراوية.
4- التآكل الأرضي: يتسبب نقص المياه في تآكل التربة خاصة في المناطق الجافة والمستوية.
5- هدر الحياة البرية: يتضرر الحياة البرية بشكل كبير في المناطق الجافة نظراً لنقص الموارد المائية والقلة من الغذاء المتاح.