تؤثر الأحكام العرفية على حقوق الإنسان في مصر سلباً بعدة طرق، ومنها:
1- تحديد حقوق النساء: ينص القانون المصري على عدم السماح للنساء بالتطلع إلى الميراث بطريقة تساوي الرجال. وتعاني النساء في مصر من العديد من القيود الاجتماعية والثقافية التي تقيد حريتهن وحقوقهن.
2- الأحكام الجنائية: تواجه الأحكام الجنائية في مصر تعليقات غالبا ما تكون على أساس الشائعات والبلاغات الاجتماعية، وقد يحصل الأشخاص على أحكام عسيرة بسبب تلك الشائعات والبلاغات.
3- حرية التعبير: تشهد مصر قيوداً كبيرة على حرية التعبير، حتى أن ممارسة الحرية في هذا الصدد يعرض الأشخاص للملاحقة القانونية، ومن الصعب القيام بالنقد الإيجابي أو المناقشة، خاصةً في الأمور السياسيه.
4- التعذيب: يتعرض الكثيرون في مصر للاعتقال غير القانوني والتعذيب وغيرها من أشكال الانتهاكات، دون إجراء أي إجراء على المسئولين عن تلك الإجراءات البشعة.
5- السجون: تواجه السجون المصرية مشاكل كبيرة فيما يتعلق بحقوق الإنسان، حيث يعيش السجناء في ظروف صعبة ولا يتم تلبية احتياجاتهم الأساسية في السجون، وقد يحكم تلك الظروف على استمرار العديد من السجناء في السجون المصرية، رغم فترة انتهاء محكوميتهم.