الجراثيم لها علاقة وثيقة بأمراض الجهاز الهضمي، فبعض الجراثيم مثل Helicobacter pylori قد يسبب التهاب المعدة وقرحة المعدة، كما أن الجراثيم المعوية مثل Salmonella و E. coli يمكن أن تسبب التسمم الغذائي. ويتم علاج بعض أمراض الجهاز الهضمي بواسطة الأدوية المضادة للجراثيم.
1