تعتبر نظم المعلومات الجغرافية (GIS) من الأدوات المهمة والحيوية لهندسة التربة المائية، حيث يمكن استخدامها في العديد من التطبيقات المرتبطة بالتصميم والتخطيط والإدارة والمراقبة والتحليل الفني لنظام الري وإدارة الموارد المائية والتحليل الجيولوجي والجيوتقني والنمذجة. وتعتبر خرائط GIS أداة مفيدة لعرض وتحليل البيانات المكانية المعقدة والمتعددة الأبعاد للتربة والمياه والنباتات والمحاصيل والأراضي.
ويمكن استخدام نظم المعلومات الجغرافية في هندسة التربة المائية في عدة مجالات منها:
1- تحديد الخصائص الأساسية للتربة والنباتات وأنواع الصخور والتضاريس وظروف الجو المختلفة.
2- تحديد المعطيات المتعلقة بالمياه الجوفية والسطحية.
3- إنشاء نماذج رقمية للأرض لتتمكن من عمل دراسات الأماكن المختلفة وتحديد تأثير العامل البيئي وعليها.
4- تصميم أنظمة الري والصرف الزراعية وإدارة الموارد المائية .
5- تحليل جوانب التغيرات المناخية والتقلبات المناخية في الفترات الزمنية المستقبلية والحالية.
6- تحديد مواقع توزيع الغازات الناتجة عن الصرف الصحي ورصد تلوث المياه الجوفية.
و يمكن الاستفادة من نظم المعلومات الجغرافية في هندسة التربة المائية في الجوانب الفنية والتطبيقية والاستخدام المستدام للموارد المائية.