تلعب البكتيريا دورًا هامًا في الكيمياء الحيوية، حيث تقوم بعدة وظائف مثل:
1- تحويل المواد العضوية إلى الأشكال اللازمة للحياة.
2- تحويل العناصر الغير عضوية إلى الأشكال العضوية اللازمة للحياة.
3- تحويل العناصر الغير عضوية إلى الأشكال العضوية المفيدة للإنسان.
4- تفكيك العناصر العضوية الميتة وإعادة تدويرها في الطبيعة.
5- تخليق المركبات الحيوية المفيدة للإنسان، مثل المضادات الحيوية والفيتامينات.
6- إنتاج الإنزيمات التي تساعد في هضم الطعام وتحويله إلى الطاقة.
7- تحويل النيتروجين الجوي إلى الأشكال النيتروجينية اللازمة للنباتات والحيوانات.