تلعب الأحياء المائية دوراً حيوياً في البيئة الإيكولوجية، وذلك لأنها تشكل جزءاً أساسياً من النظام الإيكولوجي الذي يعيش في المياه. وتشمل الأحياء المائية مجموعة متنوعة من الكائنات الحية مثل الطحالب والأسماك والحيوانات العشبية والمحاريث وغيرها.
ويتمتع الأحياء المائية بالعديد من الوظائف الإيكولوجية المهمة، منها ما يلي:
1. تغذية الكائنات الأخرى في المياه: حيث تعتبر الأحياء المائية مصدراً أساسياً للغذاء للأسماك وغيرها من الكائنات الحية في المياه.
2. دور في تنظيم دورة المواد الغذائية: حيث تقوم الأحياء المائية بتحلل المواد العضوية في المياه وتحويلها إلى مواد غذائية للكائنات الأخرى في النظام الإيكولوجي.
3. دور في تنظيم جودة المياه: حيث تعمل الأحياء المائية على إزالة بعض الملوثات والأملاح من المياه وذلك عن طريق عملية الترسيب والترشيح.
4. دور في تكوين الطبيعة الجميلة: حيث تساعد الأحياء المائية على تشكيل بعض التضاريس الطبيعية في البيئة المائية مثل الشعاب المرجانية والأرجوانية.