الكيمياء الطبية والكيمياء العضوية هما فرعان من فروع الكيمياء، ولكن لهما تطبيقات مختلفة وأهداف مختلفة.
الكيمياء العضوية تركز على الدراسة والتفاعلات الكيميائية للمركبات العضوية، وهي المركبات التي تحتوي على الكربون كمكون أساسي لها. وتشمل هذه المركبات الهيدروكربونات والألكانات والألكينات والألكينات والأملاح العضوية والمركبات الحلقية والمركبات التي تحتوي على مجموعات وظيفية مثل الكحولات والألدهيدات والأحماض الكربوكسيلية والأمينات. وتستخدم هذه المركبات في العديد من التطبيقات مثل الأدوية والبلاستيك والمنظفات والأصباغ والألياف والأدوات الصحية.
أما الكيمياء الطبية، فتركز على دراسة التفاعلات الكيميائية في الجسم البشري وتطوير العلاجات الدوائية والمواد الكيميائية الطبية الأخرى. وتشمل هذه التطبيقات دراسة العمليات الحيوية في الجسم وكيفية تفاعل الدواء معها وتأثيره على الجسم، وتطوير علاجات للأمراض المختلفة مثل السرطان وأمراض القلب والأوعية الدموية والأمراض العقلية.