العامل المحفز (Catalyst) هو مادة تسرع سرعة التفاعل الكيميائي بدون التأثير على الطاقة الحرة النهائية للتفاعل. ويمكن استخدام العوامل المحفزة في هندسة البروتينات لتحسين سرعة وكفاءة التفاعلات الحيوية التي تتم داخل الخلايا. ومن أمثلة العوامل المحفزة التي يمكن استخدامها في هندسة البروتينات:
1- الإنزيمات: وهي بروتينات تعمل كعوامل محفزة لتسهيل التفاعلات الكيميائية داخل الخلايا.
2- الحموض: وهي عوامل محفزة تسرع تفاعلات الأحماض والقواعد في الخلايا.
3- الأيونات المعدنية: وهي عوامل محفزة تساعد في تسريع التفاعلات الكيميائية وتسهيلها.
4- الحرارة: وهي عامل محفز يستخدم في هندسة البروتينات لتحسين سرعة التفاعلات الكيميائية وزيادة كفاءتها.