تلعب الأنابيب الكونية دورًا حاسمًا في نظرية الانفجار العظيم، وهي نظرية عن أصل الكون وتطوره. تعتقد هذه النظرية أن الكون نشأ من عملية انفجار كبيرة جدًا واسمها الانفجار العظيم، وهذا الانفجار الذي حدث قبل حوالي 13.8 مليار سنة أدى إلى نشوء الكون الحالي. وتقول هذه النظرية أن الأنابيب الكونية كانت موجودة في اللحظات الأولى من الانفجار العظيم، وتمتد هذه الأنابيب عبر الكون والتي تحتوي على العديد من الجسيمات المتناثرة فيها، وكانت هذه الأنابيب المسؤولة عن نقل الطاقة الحرارية والضغط الناتج عن الانفجار العظيم، وتؤثر الأنابيب الكونية بشكل كبير على هيكل وتطور الكون حتى اليوم.