توجد عدة طرق لزيادة إنتاجية المزارع المائية، ومن أهمها:
1. تطوير التقنيات الجديدة: يجب على المزارعين المائيين الاستفادة من التقنيات الحديثة المتاحة في الزراعة المائية، مثل تنظيم المزروعات بشكل مناسب وتحديد درجات الحرارة والإضاءة لضمان أفضل نمو للنباتات.
2. تحسين نوعية المياه المستخدمة: يجب التأكد من نقاء وجودة المياه المستخدمة في الزراعة المائية، وذلك لتجنب احتمالية مشاكل وأمراض النباتات.
3. تحسين الوضع البيئي للمنطقة المائية: من أجل زيادة إنتاجية المزارع المائية يجب أن يتم تحسين الوضع البيئي للمنطقة المائية، عن طريق التقليل من التلوث وإعادة تدوير المواد العضوية.
4. توفير الغذاء والأملاح: يجب تزويد النباتات في المزارع المائية بما يحتاجونه من الغذاء والأملاح المهمة لنمو النباتات وتطويرها.
5. تنظيم العمليات الإدارية: يجب التأكد من تنظيم العمليات الإدارية في المزارع المائية وتحسينها، وذلك لتحقيق أفضل عملية إنتاج وإدارة.