يمكن تنسيق التربية الدينية مع التعليم العلمي والأكاديمي عن طريق:
1- إظهار الروابط بين العلوم الشرعية والعلوم الطبيعية والإنسانية، وتفسير كيف يمكن للعلوم الشرعية أن تدعم وتؤثر على العلوم الأكاديمية والعلوم الطبيعية.
2- تعزيز فهم المفاهيم الإسلامية والقيم الأخلاقية في سياق العلوم الأكاديمية والعلوم الطبيعية، وكيفية تطبيق هذه القيم في الحياة اليومية.
3- إرشاد وتوجيه الطلاب لتطوير مهاراتهم الروحية والعقلية مثل الصبر والتسامح وإدارة الوقت والقيادة، والتعريف بالأدوات والمناهج الدينية التي تساعدهم على تحقيق هذه المهارات.
4- تعزيز الوعي الديني من خلال المادة الدراسية، ومناقشة القضايا الاجتماعية والأخلاقية والأخلاقية والدينية، ودعم الطلاب لاتخاذ القرارات المناسبة والاختيارات الحرة مع مراعاة القيم والأخلاق الدينية.
5- إدماج النشاطات الدينية في المناهج الأكاديمية والعلمية، مثل الصلاة والصيام والصدقة، لإعطاء الطلاب التجربة التمهيدية لحياة دينية متكاملة.