تعتمد طريقة الحصول على الجزيء المطلوب في الكيمياء الفوق جزيئية على الطريقة المستخدمة لتحضير الجزيء. هناك عدة طرق لعزل الجزيء المطلوب، بما في ذلك:
1- التحضير الكيميائي: يتم تحضير الجزء المطلوب بالتفاعل والتحضير الكيميائي، ثم يتم عزله عن الأشياء الأخرى في المخلوط بعد إجراء الفصل الحراري أو الإزالة الكروماتوغرافي.
2- التحضير الكروماتوغرافي: يتم فصل الجزيء المطلوب باستخدام تقنية الكروماتوغرافي، ويتم عزله عن الأشياء الأخرى في المخلوط بعد إجراء الفصل الكروماتوغرافي.
3- الكشف الكهروفوريتيك: يتم الكشف عن الجزء المطلوب بواسطة الكشف الكهروفوريتيك، ويتم عزله عن الأشياء الأخرى في المخلوط بعد إجراء الفصل الكهروفوريتيك.
4- استخدام الطرق المغناطيسية: يمكن استخدام الطرق المغناطيسية لعزل الجزيء المطلوب من المخلوط الكيميائي.
5- التحليل الطيفي: يمكن استخدام التحليل الطيفي لتحديد تركيز الجزء المطلوب في المخلوط الكيميائي، ثم يتم عزله بناءً على هذه القيمة.
تعتمد الطريقة المثلى لعزل الجزء المطلوب على الجزيء نفسه وشروط التحضير والفصل، ودرجة تنقية الجزيء المطلوب، فقد يتطلب الأمر استخدام أكثر من طريقة لتنقية الجزيء والحصول على أعلى مستويات التنقية.