يمكن التحكم بأردوينو ميجا عن طريق البرمجة باستخدام لغة برمجة Arduino. يجب توصيل الأردوينو بجهاز الكمبيوتر الخاص بك عن طريق كابل USB. ثم يمكنك استخدام بيئة التطوير المتكاملة (IDE) لأردوينو لكتابة الشفرة وتحميلها على الأردوينو.
في الشفرة، يمكنك استخدام مجموعة متنوعة من الوظائف والمكتبات المتاحة في Arduino IDE للتحكم بالمداخل والمخارج الرقمية والتناظرية والاتصال بأجهزة إضافية مثل الشاشات والمحركات وأجهزة الاستشعار وغيرها. يتم تنفيذ الشفرة على الأردوينو ميجا وتعمل بشكل مستقل بمجرد تشغيلها.