يمكن استخدام هندسة البروتينات في التشخيص والعلاج في الطب عن طريق تصميم بروتينات جديدة أو تعديل بروتينات موجودة بحيث تناسب احتياجات المرضى. ومن الأمثلة على ذلك:
1- تصميم بروتينات جديدة للعلاج: يمكن تصميم بروتينات جديدة للعلاج من خلال تحويل وظائف بروتينات موجودة أو تصميم بروتينات جديدة تمامًا. ومن الأمثلة على ذلك تصميم بروتينات للتعامل مع الأمراض المناعية المتعلقة بالأجسام المضادة، مثل السرطان والتهاب المفاصل.
2- تعديل بروتينات موجودة: يمكن تعديل بروتينات موجودة بحيث تحسن من فعاليتها أو تقلل من آثارها الجانبية، كما يمكن تعديل بروتينات المناعة الطبيعية لتحسين استجابة المناعة للعلاجات الحديثة.
3- الاستخدام في التشخيص: يمكن استخدام بروتينات معدلة جينياً في التشخيص، حيث يمكن استخدامها لتحديد وجود المرض أو قياس مدى تقدم أو تفاعل المرض. وهذا يمكن أن يساعد في اكتشاف الأمراض في مراحلها المبكرة والبدء في العلاج المناسب في الوقت المناسب.
4- الاستخدام في الأبحاث: يمكن استخدام هندسة البروتينات في الأبحاث الطبية لفهم آليات الأمراض وتطوير العلاجات الجديدة. ويمكن استخدام بروتينات معدلة جينياً لتحليل الدوائر الجينية والتعرف على العوامل المؤثرة في الأمراض المختلفة.