يمكن استخدام موارد الأنظمة البيئية المائية في تحسين الزراعة والثروة الحيوانية عن طريق التالي:
1- استخدام مياه الأنهار والمياه الجوفية للري: يمكن جمع مياه الأنهار والمياه الجوفية واستخدامها في الري لزراعة المحاصيل. يمكن أيضًا استخدام هذه الموارد المائية لإنتاج المزيد من الغذاء لتحسين الثروة الحيوانية.
2- استخدام الأسمدة الطبيعية: يمكن استخدام مخلفات الأحياء الدقيقة والمواد العضوية الأخرى كأسمدة طبيعية للنباتات والمحاصيل. وهذا سيؤدي إلى تحسين محاصيل الطعام وتخفيض التكاليف الإنتاجية.
3- الاهتمام بالبيئة البحرية: يمكن الاهتمام بالتنوع البيولوجي وتدابير الحفاظ على البيئة البحرية، والتي يمكن أن تحسن من إنتاج الأسماك الطازجة والمنتجات المرتبطة بها، وبالتالي تحسين الثروة الحيوانية.
4- تحسين جودة المياه: يمكن تحسين جودة المياه بتخفيض النفايات الزراعية المسببة للتلوث، وكذلك بالاستفادة من تقنيات المعالجة الحيوية التي تهدف إلى إزالة الملوثات وتحسين جودة المياه.
5- التحول إلى الزراعة العضوية: يمكن التحول إلى الزراعة العضوية التي تستخدم الموارد الطبيعية وتحافظ على البيئة. وهي تحسن المحاصيل وتتطلب تكاليف إنتاجية أدنى، كما أنها تحافظ على سلامة الأغذية.