يمكن استخدام التصوير الحيوي في تطبيقات هندسة الميكانيكا الحيوية على النحو التالي:
1- دراسة حركة الخلايا: يمكن استخدام التصوير الحيوي لدراسة حركة الخلايا وتحليل تفاعلاتها مع بعضها البعض ومكونات الجدران الخلوية والأنسجة المختلفة.
2- تحليل الفعالية الحيوية للأعضاء: يمكن استخدام التصوير الحيوي لتحليل الفعالية الحيوية لمجموعة من الأعضاء المختلفة والتعرف على كيفية عملها واستجابتها للتغيرات البيئية المختلفة.
3- تحليل التوازن والاستقرار: يمكن استخدام التصوير الحيوي لتحليل التوازن والاستقرار للكائنات الحية حيث يتم التعرف على التغيرات البيئية التي تؤثر على هذه الكائنات والتغيرات المختلفة في البيئة الخارجية.
4- الدراسات التأثير الهيدروديناميكي: يمكن استخدام التصوير الحيوي لتحليل تأثير الهيدروديناميكي على السباحة الحيوانية والأجزاء المختلفة من الكائنات الحية.
5- الدراسات التأثير الحيوي للأدوية: يمكن استخدام التصوير الحيوي لدراسة تأثير الأدوية المختلفة على الأعضاء والخلايا وتحليل تفاعلاتها مع أنظمة الجسم المختلفة.