تختلف طريقة تنظيم وتمويل الرحلات الاستكشافية حسب نوعها وهدفها، ومن بين الطرق المتبعة:
1- تمويل شركات الرحلات الاستكشافية: حيث تقوم شركات الرحلات الاستكشافية بجمع الأموال من المستثمرين والمتبرعين والحكومات المحلية والدولية، ثم تخصيص جزء من هذه الأموال لتنظيم رحلات استكشافية على أحدث الأساليب والتقنيات.
2- تمويل الحكومات: حيث تتكفل الحكومات المحلية أو الدولية بتنظيم رحلات استكشافية بهدف دراسة واستكشاف بيئات جديدة وتسجيل تأثير التغير المناخي والظواهر الجيولوجية والبيولوجية وغيرها، وبالتالي عمل خرائط جغرافية وعلمية أكثر دقة.
3- تمويل الجامعات والباحثين: حيث تتكفل الجامعات والمؤسسات العلمية بتنظيم رحلات استكشافية، بهدف القيام بالأبحاث العلمية وتطوير المعرفة في المجالات المختلفة، وتسجيل النتائج كما هي دون التركيز على الجانب الاقتصادي لكل رحلة.
4- التمويل الذاتي: حيث يتبرع الأفراد المهتمون برحلات الاستكشاف بشكل شخصي، ويقومون بتنظيم الرحلات بشكل تطوعي وبتكاليف متدنية، وتكون هذه الرحلات عادة مخصصة للمناطق الصحراوية والمحميات الطبيعية.