تنظيم الحسابات في المحاسبة الحكومية يخضع لمبادئ ومعايير المحاسبة الحكومية والتي تحدد الطريقة الصحيحة لإعداد وتنظيم الحسابات. وتتضمن هذه المعايير العديد من القواعد الخاصة بالحسابات المالية المحاسبية.
عادة ما يتم تنظيم الحسابات في المحاسبة الحكومية وفقًا لخطة الحسابات المحددة مسبقًا والتي تختلف حسب نوع المؤسسة الحكومية وطبيعة أعمالها. وتشمل هذه الخطة الحسابية قائمة بجميع الحسابات الصالحة للمؤسسة الحكومية، والتي تُستخدم لتسجيل العمليات المحاسبية والمالية.
وتتضمن خطة الحسابات الحكومية عادة الحسابات المالية الرئيسية مثل النفقات والإيرادات والأصول والخصوم وغيرها، كما تحتوي على أرقام مرجعية وكودات محددة لكل حساب.
وبالإضافة إلى ذلك، تشتمل المحاسبة الحكومية على الإجراءات المحاسبية المتعلقة بتداول النقد والتوريدات والمدفوعات، والتدقيق المحاسبي والمالي، وإعداد التقارير المالية الشهرية والسنوية، وغيرها من الإجراءات المالية الأساسية.