يؤثر التلوث بشكل كبير على نمو المحاريات وقد يسبب تدهوراً في حالة البيئة المائية وتغيرات في التركيب الجزيئي للمياه التي يعيشون بها. ويمكن أن يؤثر التلوث بطرق مختلفة مثل:
1. تلوث المياه: يتمثل التلوث في وجود مواد كيميائية مثل الزئبق والكادميوم والنحاس في المياه والتي يمكن أن تسمم المحاريات.
2. التلوث البكتيري: وجود العوالق والبكتيريا غير الصحية في المياه يؤثر على المحاريات ويمكن أن يسبب تلفاً في أنظمة جهازها الهضمي.
3. التغيرات في درجة حرارة المياه: يؤثر ارتفاع درجة حرارة المياه بسبب التلوث كمصدر للتغييرات في النمو والتكاثر وعلى الصحة العامة للمحاريات.
في النهاية، تؤدي أي تلوثات تؤثر على محيط المحاريات إلى تغييرات في جودة المنتج الذي يتم استهلاكه. ولذلك، يجب العمل على حماية بيئة المحاريات وتقليل النقص الإيكولوجي الناجم عن النشاط البشري الذي يصيبهم، والحرص على إدارة الموارد المائية بطريقة مستدامة وفقدان الحيوانات في الخلايا الزرقاء الضارة والتقليل من التلوثات العضوية و / أو العضوية التي تسبب ذلك التقليل.