بعد الإصلاح البروتستانتي ، تغيرت الكنيسة بشكل كبير في العديد من الجوانب ، من بينها:
1- فتح المجال للتفسير الشخصي للكتاب المقدس وإلغاء السيطرة البابوية على تفسيره.
2- إلغاء بعض الممارسات الكاثوليكية التي كانت تتعارض مع مبادئ الإصلاح ، مثل العبادة للأشخاص المقدسين والتوسط في الصلاة من خلال القساوسة.
3- تعزيز المسؤولية الفردية للمؤمنين في الممارسات الدينية وتحرير العبادة من الرموز والتقاليد البابوية.
4- إصلاح نظام الكنيسة الرومانية وتقليل السيطرة البابوية ومواجهة الفساد الكهنوتي.
5- تعزيز المحاسبة والشفافية في الكنيسة من خلال تشكيل اللجان والمجالس للمراجعة والإشراف.
6- تم الاعتراف بالكنيسة البروتستانتية رسمياً في العديد من دول أوروبا وتحولت إلى الكنيسة الرسمية.
7- ظهرت فروع مختلفة من الإصلاح البروتستانتي ، مثل اللوثريون والكالفيني والأنجليكانيين ، وأصبحت كل فرع له تعاليم وقيم خاصة به.