تشكلت الكنيسة البروتستانتية في القرن السادس عشر في أوروبا، نتيجة للحركة الدينية والاصلاحية التي قادها القس مارتن لوثر وغيره من الشخصيات الدينية المهمة. في عام 1517، قام لوثر بنشر 95 مقالة احتجاجية على ممارسات الكنيسة الكاثوليكية، وهذا ما أعطى بداية للإصلاح البروتستانتي.
تعارض البروتستانتية مع الكاثوليكية في العديد من النقاط، مثل الثقافة الدينية والممارسات الدينية والهرمية الكنسية. وقد تطورت الكنيسة البروتستانتية إلى عدة فروع وتجاذبات مختلفة مثل اللوثرية والكالفينية والأنجليكانية وغيرها.
تأسست الكنيسة اللوثرية في ألمانيا، والكنيسة الكالفينية في سويسرا وفرنسا وأسكتلندا، والكنيسة الأنجليكانية في إنجلترا. كانت هذه الفروع تختلف في بعض التفاصيل الدينية والممارسات الكنسية، ولكنها تشترك في رفضها لسلطة البابا والمساهمة في اصلاح الكنيسة.