تساعد هندسة البروتينات في فهم تركيبة الحمض النووي وترجمته من خلال تحديد التراكيب المثلى للبروتينات المتفاعلة مع الحمض النووي. عندما يتفاعل الحمض النووي مع البروتينات المناسبة، فإنه يتم تحديد تركيبة الحمض النووي وترجمته بشكل صحيح. بالإضافة إلى ذلك، فإن هندسة البروتينات تستخدم لتحديد التفاعلات بين البروتينات المسؤولة عن البنية الثلاثية للحمض النووي وترجمته، وتحديد كيفية تفاعل البروتينات مع الحمض النووي وكيفية تشكيل البروتينات المختلفة لإنتاج الوظائف الحيوية المختلفة في الخلايا.
