تختلف بنية نظام Windows NT عن أنظمة التشغيل الأخرى في العديد من النواحي، ومنها:
1- نظام الملفات: يعتمد نظام Windows NT على نظام ملفات NTFS (New Technology File System) الذي يمكنه تحمل تنسيقات ملفات أكبر من FAT، كما يمكنه تشفير الملفات وتحديد مساحات تخزين محددة للمستخدمين.
2- الحماية والأمان: يعتبر نظام Windows NT أكثر أمانًا من أنظمة التشغيل الأخرى حيث يوفر أدوات تحكم في التحقق من الهوية والوصول للملفات والمجلدات والبرامج.
3- القدرة على العمل مع الشبكات: يعتبر نظام Windows NT من أحد الأنظمة الأساسية التي يمكن استخدامها في الشبكات الكبيرة حيث يوفر ميزات الاتصال العالي السرعة والقدرة على العمل مع بعض الخوادم وحماية البيانات المنقولة.
4- استقرار النظام: يعد نظام Windows NT من أنظمة التشغيل الاستقرارية حيث يتميز بالقدرة على التعامل مع الأخطاء وإصلاحها بمعنى آخر يمكنه العمل لفترات طويلة دون تعطل أو توقف.
5- الأداء: يتميز نظام Windows NT بأدائه العالي وهو يعمل على مجموعة متنوعة من المعالجات ويمكن تشغيله على الأجهزة التي تستخدم ذاكرة وحدة المعالجة المركزية أو المعالجات متعددة النوى.