تتفاعل الكائنات الحية الوحيدة الخلية مع الطفيليات والجراثيم من خلال عدة طرق، بما في ذلك:
1- الاستجابة المناعية: تنتج الخلايا في الكائنات الحية الوحيدة الخلية بعض المواد التي تقتل الطفيليات والجراثيم وتحاربها، وتستخدم أيضًا الأجزاء الداخلية للبكتيريا والفيروسات كخلايا مضادة لتوليد مناعة ضد هذه الأنواع الحية.
2- الهجوم الكيميائي: تنتج بعض الكائنات الحية الوحيدة الخلية مواد كيميائية مضادة للجراثيم والطفيليات، وتستخدمها لمهاجمة الأجسام الحية الأخرى.
3- الفرز الخلوي: قد تستخدم الكائنات الحية الوحيدة الخلية مخرجاتها الخلوية لإبطاء نمو الجراثيم والطفيليات، وتحجز المواد المغذية اللازمة لهذه الأنواع الحية.
4- الأيض الثانوي: يمكن للكائنات الحية الوحيدة الخلية أن تحول الجزيئات غير الضارة إلى مركبات سامة تؤثر على الطفيليات والجراثيم.
بشكل عام ، فإن استجابة الكائنات الحية الوحيدة الخلية تتعلق بنوع الطفيليات أو الجراثيم وروابطها مع الخلية المضيفة. يمكن أن يتم التصدى للطفيليات والجراثيم من خلال تكوين أغشية حول الخلية أو إلى جانب الهجوم الكيميائي.