لا يمكن الحكم على جودة التعليم في الجامعات المصرية بشكل عام، فقد تختلف جودة التعليم من جامعة لأخرى ومن كلية لأخرى داخل نفس الجامعة. إلا أنه يمكن القول بأن العديد من الجامعات المصرية تواجه تحديات في تأمين مستويات التعليم العالية والمتطورة التي يطالب بها الطلاب والأساتذة. وتتصدر هذه التحديات نقص الموارد المالية والبشرية وضعف الهيكلية والتنظيم الإداري للجامعات.
علاوة على ذلك، تواجه الجامعات في مصر تحديات في تأمين التدريب المهني والتقني للطلاب، وتعزيز المهارات العملية والعقلية، وتوفير بيئة تعليمية صحية وآمنة. وتعمل الحكومة المصرية على تطوير البنية التحتية للجامعات في البلاد، وزيادة الاستثمار في التعليم العالي، وتطوير مناهج التعليم وتحسين جودة التدريس والتدريب. ومن المهم أيضا تشجيع البحث العلمي وتوفير فرص الابتكار وربط الجامعات بالصناعة والمجتمع المحلي لتطوير الخريجين والتعليم العالي في مصر بشكل عام.
