التغيرات المناخية تؤثر بشكل كبير على هندسة التربة المائية ، حيث تؤدي إلى تغيير طبيعة الأمطار والتيارات النهرية وعمق المياه في المنابع المائية وتوزيع الموارد المائية في جميع أنحاء العالم. هذه التغيرات تؤثر بشكل كبير على تصميم المنشآت المائية وإدارتها ، ومن ثم يجب على المهندسين المائيين ومهندسي التربة العاملين في هذا المجال اتخاذ إجراءات الاحتياطية لتوفير المزيد من المياه وضمان الاستدامة. فيما يلي بعض الطرق التي يمكن من خلالها التعامل مع هذه التحديات:
1- تقدير مخاطر الفيضانات وتطوير مواقع تخزين الفيضانات قابلة للتوسع.
2- تطوير نظم لتدوير المياه لتحسين استدامة الموارد المائية.
3- تطوير التقنيات الحديثة لتقليل تأثير التغير المناخي على المنشآت المائية.
4- تحسين صيانة وتقييم الأنظمة المائية للتأكد من استخدامها بكفاءة أكبر.
5- الاستثمار في تطوير نظم الري الحديثة لتحسين كفاءة استخدام المياه وتقليل الهدر.