ظهور وسائل التواصل الاجتماعي في مصر قد أثر بشكل كبير على الصحافة الاستقصائية. فبفضل هذه الوسائل، أصبح من الممكن للصحفيين الاستقصائيين الوصول إلى المعلومات بسرعة وسهولة كبيرة دون الحاجة إلى التنقل والتحرك. وبالتالي، فإن وسائل التواصل الاجتماعي أعطت الصحافة الاستقصائية في مصر رقعة للعمل أكبر.
ولكن، فإن استخدام وسائل التواصل الاجتماعي في الصحافة الاستقصائية أدى أيضاً إلى المشاكل والتحديات الجديدة. فقد أصبح من الصعب التحقق من مصادر الأخبار والمعلومات، وتحديد صحتها، وذلك بسبب الكم الكبير من المعلومات المتدفقة عبر هذه الوسائل، والتي يتعين على الصحافي الاستقصائي مراجعتها والتأكد من صحتها.
كما أن استخدام وسائل التواصل الاجتماعي للتواصل مع المصادر والمعلومات، يشكل تحدياً جديداً أيضاً. فقد يتعين على الصحافي الاستقصائي التعامل مع مصادر غير موثوق بها، أو مصادر تستخدم الحسابات المزيفة، والتي يجب التحقق منها جيداً قبل الاعتماد عليها.
إلى جانب ذلك، فإن استخدام وسائل التواصل الاجتماعي قد أدى إلى توجيه الضوء على بعض الفضائح والفساد والانتهاكات والمخالفات، والتي تم الكشف عنها بواسطة الصحافة الاستقصائية، وعرضت للجمهور عبر هذه الوسائل. وبالتالي، فإن وسائل التواصل الاجتماعي قد أدت إلى زيادة الوعي العام حول هذه القضايا، وزيادة الضغوط على الحكومة والجهات المعنية لاتخاذ الإجراءات اللازمة.