تأثرت التجارة في بلاد ما وراء النهر بشكل كبير جراء الغزوات التي حدثت على المنطقة. فقد أدى الغزو الإسلامي لنزع السيطرة الفارسية على المنطقة، وهذا تسبب في تغير شديد للتجارة.
كانت بلاد ما وراء النهر موطناً للعديد من الشعوب المختلفة، وتعاونت هذه الشعوب في التجارة والتبادل التجاري. ولكن بعد الغزو الإسلامي، تغيرت الأوضاع مع تأسيس خلافة عباسية في بغداد، وتسببت هذه الحكومة في إنشاء نظام تجاري جديد في المنطقة.
ورغم أن التجارة لا تزال متواجدة في بلاد ما وراء النهر، إلا أنها انخفضت بشكل كبير، وخصوصاً في المناطق التي كانت تعاني من الحروب والصراعات. وقد نتج عن ذلك تدهور الاقتصاد المحلي في بلاد ما وراء النهر. لكن مع مرور الوقت، تم العودة إلى العلاقات التجارية بين مختلف الشعوب والحكومات، وعاد التجار إلى بلاد ما وراء النهر للتجارة والتبادل التجاري مرة أخرى.