لغات البرمجة

تنسيق Stockholm: مقالة ويكيبيديا

تم إنشاء تنسيق Stockholm من قبل مجتمع Pfam و Rfam لنقل توافقات تسلسل البروتين والحمض النووي RNA. يتم دعم تنسيق Stockholm من قبل برامج تحرير التوافقات مثل Ralee و Belvu، بالإضافة إلى أدوات البحث في قواعد البيانات الاحتمالية مثل Infernal و HMMER، وأداة تحليل التطور الفيلوجيني Xrate. يتضمن تنسيق Stockholm البيانات الرئيسية مثل الهوية والتوصيف والمراجع المنشورة للتوافق، بالإضافة إلى المعلومات الخاصة بالتوافقات والمزيد. يمكن لملف Stockholm الأساسي أن يتألف من رأس يحدد التنسيق ومعرف الإصدار، متبوعًا بالتسلسلات وأسماء التسلسلات المميزة المتناغمة، ويختتم بخط يشير إلى نهاية التوافقية. يمكن أن تتضمن رسائل السلسلة أي حروف تعبر عن السلسلة باستثناء الفراغات، ويمكن تمثيل الفجوات بـ “.” أو “-“. تعتبر العناصر المعروضة في تنسيق Stockholm مفيدة للغاية لتمثيل البيانات الخاصة بالتوافقات وتحليلها بشكل فعال، ويتميز بوجود مثال بسيط ومثال أكثر تعقيدًا يوضحان استخدام هذا التنسيق بوضوح. توفر معلومات وتسهلية مثل هذه تسهل عملية فهم وتحليل التوافقات الحيوية بشكل كبير.

لمزيد من المعلومات، يمكنك زيارة صفحة ويكيبيديا لتنسيق Stockholm على الرابط التالي: Stockholm format on Wikipedia