تعتبر نقاط التحكم الرئيسية في المحاسبة الحكومية هي:
1- العد التدقيقي: وهو عملية الإحصاء والفحص المنهجي للبيانات والمعلومات المالية والمحاسبية.
2- التزامن: وهو التأكيد على أن كل العمليات المالية والمحاسبية تتم في الوقت المناسب والمطلوب.
3- الفحص الداخلي: وهو نوع من أنواع الضوابط التي تتلخص في فحص كل عملية مالية من قبل مجموعة من الأفراد غير المعنيين بالعملية بهدف التأكد من صحتها وشرعيتها.
4- التحقق من الشفافية: وهو الالتزام بتوثيق كل العمليات المحاسبية وإعلانها للجمهور بشفافية تامة.
5- المراجعة الخارجية: وهي ضوابط تقوم بها مصالح خارجية غير معنية بتلك العمليات المحاسبية، بهدف التأكد من صحتها وشرعيتها.