عملية الأكسدة في الكيمياء الحيوية تتكون من ثلاث مراحل:
1- نقل الإلكترونات: تبدأ عملية الأكسدة بانتقال الإلكترونات من المركب العضوي إلى المركب القابل للتخليق، ويتم هذا بواسطة الإنزيمات.
2- إنتاج الطاقة: يتم إنتاج الطاقة في هذه المرحلة بواسطة سلسلة من التفاعلات الكيميائية والتي تتضمن تفاعلات الأكسدة والتخفيض.
3- إعادة التأهيل: عندما تنتهي عملية الأكسدة، يتم تجميع الإلكترونات في المركبات الإلكترونية القابلة للاستخدام. وهذا يحدث من خلال التفاعلات الكيميائية التي تسمى تفاعلات الأيض الثانوي. ويتم استخدام الطاقة الكيميائية المنفرجة خلال عملية الأكسدة لتعزيز العمل الحيوي داخل الجسم.