توجد بعض العيوب المحتملة للاستخدام الحصري للعقود الإلكترونية، وتشمل:
1- قلة الأمان: تعتبر العقود الإلكترونية أقل أمانًا مقارنة بالعقود التقليدية وقد يتعرض النظام الإلكتروني للاختراق والتلاعب.
2- ضعف إثبات المعلومات: قد تكون العقود الإلكترونية أقل إثباتًا من العقود الورقية في بعض الحالات خصوصًا إذا تم إجراء التعاملات عبر الإنترنت أو عن بعد.
3- مشكلات الترجمة: قد يحدث تعذر ترجمة العقود الإلكترونية إلى لغات أخرى وقد يؤدي ذلك إلى عدم وضوح البنود والشروط.
4- القوانين الدولية: قد يواجه المستخدمون صعوبة في الوفاء بالقوانين الدولية بسبب اختلاف قوانين الدول المختلفة.
5- التعامل مع المعلومات الحساسة: قد تتضمن بعض العقود الإلكترونية معلومات حساسة مثل المعلومات المالية والبنكية وقد يتم فتح هذه المعلومات لخطر الاختراق والتلاعب.