توجد عدة طرق للتجزئة الكيميائية للمواد الطبية وتشمل:
1- التحليل الحمضي-القاعدي: وتستخدم هذه الطريقة بشكل أساسي لتحليل الأحماض الأمينية في البروتينات والحموض النووية.
2- الأكسدة والاختزال: حيث يتم تفاعل المادة المراد تجزئتها مع الأكسجين أو المواد الأخرى التي تتفاعل معها لتكوين منتجات أكسدة أو اختزال، ويتم تفاعل هذه المنتجات مع مواد تحدد هدف التجزئة.
3- الهيدروليز: يتم تفكيك الموليكول إلى موليكولين أصغر باستخدام الماء، وتستخدم هذه الطريقة عادة لتحليل البروتينات والأحماض النووية.
4- التخمر: يتم استخدام هذه الطريقة لتحويل المواد العضوية إلى منتجات أكثر بساطة باستخدام الكائنات الحية، مثل البكتيريا والفطريات.
5- التحليل بالغرض: وهي طريقة تستخدم للعثور على عنصر معين أو مجموعة في المادة المراد تجزئتها، ويتم استخدام تفاعلات كيميائية محددة لهذا الغرض.