تستخدم المكتبات الرقمية في البحث العلمي على النحو التالي:
1- البحث في قواعد البيانات: حيث يمكن للباحث الوصول إلى مجموعة كبيرة من الأبحاث والدراسات المنشورة في العديد من المجلات العلمية المعتمدة، وذلك من خلال استخدام قواعد البيانات المتاحة في المكتبات الرقمية.
2- الحصول على الكتب الإلكترونية: حيث يمكن الحصول على الكتب الإلكترونية من المكتبات الرقمية بسهولة ويسر، وهذا يوفر الوقت والجهد في البحث والدراسة.
3- البحث عن الأبحاث الجديدة: حيث يمكن للباحث العثور على الأبحاث الجديدة والمنشورة مؤخراً في المجلات العلمية المختلفة، وذلك من خلال تصفح المكتبات الرقمية والبحث في قواعدها.
4- التواصل مع الباحثين الآخرين: حيث يمكن للباحث التواصل مع الباحثين الآخرين في مجاله عبر المكتبات الرقمية، وذلك للتعاون في البحث والتبادل العلمي.
5- تخزين المراجع: حيث يمكن للباحث تخزين المراجع التي يحتاجها في البحث في مكتبة رقمية، مما يسهل عليه الوصول إليها لاحقاً.