1- الحفريات الأحفورية: وهي البقايا العظمية للكائنات الحية القديمة مثل الديناصورات والحيوانات العملاقة.
2- الحفريات النباتية: وهي بقايا النباتات القديمة التي تختلف عن الحفريات الحيوانية.
3- الحفريات الدقيقة: وهي البقايا الصغيرة جداً للكائنات الدقيقة مثل الدياتومات والصدفيات.