تتضمن تطبيقات الهندسة البيولوجية في العلوم الطبية العديد من المجالات المختلفة، من بينها:
1- تصميم الأجهزة الطبية: تستخدم الهندسة البيولوجية في تصميم العديد من الأجهزة الطبية التي تساعد في تشخيص وعلاج الأمراض، مثل جهاز التصوير بالرنين المغناطيسي والأجهزة الطبية الصغيرة مثل مراقبة ضغط الدم ومضخات الأدوية.
2- تطوير المواد الحيوية: تستخدم الهندسة البيولوجية في تطوير مواد حيوية للاستخدام في التجميل وعلاج الجروح والإصابات.
3- الهندسة الوراثية: تستخدم الهندسة البيولوجية في تحسين الصفات الوراثية للأنواع الحية وإنتاج التكنولوجيا الجديدة، مثل إنتاج الأغذية المعدلة وراثياً.
4- الأبحاث الطبية: يستخدم الهندسة البيولوجية لتطوير الأبحاث الطبية وتحليل البيانات وتحسين فهمنا للعمليات البيولوجية.
5- إدارة وتخزين البيانات الطبية: تستخدم الهندسة البيولوجية في تطوير نظم إدارة وتخزين البيانات الطبية وتحليلها بصورة أكثر فعالية وسهولة.
6- التعاون بين العلوم الحيوية والهندسة: يستخدم العلماء في الهندسة البيولوجية خبراتهم في التعاون مع علماء الحياة الحيوية لتطوير تحليلات متقدمة وإيجاد حلول جديدة للمشاكل الصحية المستعصية.