تؤثر صناعة البحار على الأحياء البحرية العميقة بعدة طرق، منها:
1- تلوث المياه: يؤدي تفريغ المخلفات الصناعية والنفطية في المياه إلى تلوث الماء وتأثيره على الأحياء البحرية العميقة.
2- الصيد الجائر: يؤدي الصيد الجائر والممارسات الصيدية غير المستدامة إلى تدمير الأحياء البحرية العميقة وتقلص عددها.
3- انبعاثات الغازات الدفيئة: يؤدي انبعاث الغازات الدفيئة من الصناعات والنقل البحري إلى ارتفاع درجة حرارة البحار والمحيطات، مما يؤثر على التوازن البيئي للأحياء البحرية العميقة.
4- التغيرات الجيولوجية: يمكن أن تؤثر عمليات الحفر والتنقيب عن النفط والغاز الطبيعي في تغيير التضاريس البحرية وتحريك التربة البحرية، مما يؤدي إلى تغيرات في بيئة الأحياء البحرية العميقة.