تعتمد الكائنات الحية البحرية في بيئتها الطبيعية على المنافذ الحيوية الطبيعية للتغذية والتنفس والتكاثر والتنشيط العصبي والتفاعلات الكيميائية والفيزيائية الأخرى التي تدعم حياتها. وقد تختلف هذه المنافذ بين الأحياء البحرية المختلفة، ويمكن تقسيمها بشكل عام إلى الأنيفات والخياشيم والديدان البحرية والرخويات والقناديل البحرية والأسماك والحيتان وغيرها.
وتشمل المنافذ الحيوية الطبيعية في الأنيفات والخياشيم والديدان البحرية فتحات التنفس والفم والشرج وفتحات الإخراج البولي والتنفسي والتناسلي والهضمي. كما يستخدم البعض منها الجلد أو الأشعة فوق البنفسجية للتزود بالأكسجين والعناصر الأخرى اللازمة للحياة.
ومن بين المنافذ الحيوية الطبيعية في الرخويات فتحات التنفس والفم والجهاز العصبي والجهاز الهضمي والغدد، بينما تستخدم القناديل البحرية ذراعيها المختلفة، بما في ذلك الشوكولاتة والدولاب والأنياشم، للتنفس والتحرك والتغذية.
أما بالنسبة للأسماك والحيتان، فيوجد لديها خصيصة نخيل السبعة المساعدة على التنفس ومعينات الحواس والفك والزعانف والجهاز العصبي والهضمي. كما تستخدم الحيتان أنفاسها في تنفس الهواء بعد طفراتها من السطح.