تواجه الحكومات العديد من المشكلات القانونية في مكافحة التجارة بالبشر، ومنها:
1- عدم وجود تشريعات قانونية قوية وفعالة لمكافحة التجارة بالبشر.
2- عدم وجود تعاون دولي قوي وفعال في مكافحة التجارة بالبشر.
3- عدم قدرة الدولة على تطبيق القوانين والعقوبات المنصوص عليها في حالات التجارة بالبشر.
4- صعوبة التحقيق وجمع الأدلة في حالات التجارة بالبشر، وذلك بسبب تعقيد العمليات التي يتم من خلالها اختطاف وتهريب الضحايا.
5- عدم وجود تمويل كافي لتنفيذ الخطط والبرامج المخصصة لمكافحة التجارة بالبشر.
6- صعوبة تحديد الحدود بين التجارة الغير مشروعة والعمل الشرعي في بعض الحالات، وهو ما يجعل من الصعب تحديد ماهية التجارة بالبشر وتحديد العقوبات المناسبة.