تشمل المؤسسات الحكومية في هندوراس:
1- الرئاسة: تحكم هذه المؤسسة السياسية وتشمل حكومة البلاد ورئيس الدولة.
2- البرلمان: يتكون من مجلسي النواب والشيوخ ويتولى تشريع القوانين والمراقبة على الحكومة.
3- القضاء: يمثله المحاكم والمحامون ويسهم في حفظ العدل وإقرار العقوبات والثناء على الحريات الفردية والمساواة.
4- الشرطة الوطنية: تعمل هذه المؤسسة في بعض الأحيان بشكل مشترك مع الجيش لحماية الأفراد والممتلكات وإعلاء القانون والنظام.
5- وزارات الحكومة: تشمل وزارات الدفاع والداخلية والصحة والتعليم والزراعة والتنمية والبيئة والموارد الطبيعية والأشغال العامة، وتعمل جميعاً على تنمية الاقتصاد وزيادة الفرص وحسن إدارة الموارد المتاحة.