تختلف معاجم المعرب والدخيل بالعديد من الجوانب، ولكن الفروق الأساسية بينهما تتمثل في:
1- اللغة: معجم المعرب يتضمن الكلمات والمفردات التي تعود إلى العربية الفصيحة والأصلية، بينما معجم الدخيل يتضمن الكلمات والمفردات التي تأخذ من اللغات الأخرى، مثل الإنجليزية والفرنسية والألمانية.
2- الوظيفة: يعتبر معجم المعرب هو المرجع الرئيسي للغة العربية ويهتم بتحديد الأصل والمعنى الصحيح للكلمات، بينما معجم الدخيل يستخدم كأداة لتوسيع المفردات وتحسين فهم الكلمات في اللغة المطروحة.
3- الجمهور المستهدف: يلجأ المتحدثون بالعربية بشكل عام إلى معاجم المعرب، بينما يهتم المتحدثون باللغات الأجنبية بدراسة معاجم الدخيل.
4- التصميم والترتيب: تفتقر معاجم المعرب عادةً إلى الصور والرسومات ولا تهتم بالتصميم الجذاب، بينما تحتوي معاجم الدخيل على رسومات وصور للتعلم السهل. كما أن معاجم المعرب تقسم الكلمات حسب الحروف الأبجدية، بينما تقسم معاجم الدخيل الكلمات حسب الموضوعات والأقسام.