تصميم الأبنية الضخمة في المدن الكبرى يواجه العديد من التحديات، وهي كالتالي:
1- الكثافة السكانية: تزيد التحدُّيات كلما زادت الكثافة السكانية في المدينة. ومن أجل استيعاب عدد كبير من السكان في مساحة محدودة، يجب تصميم الأبنية بطريقة تمكن من الاستفادة الكاملة من كل سنتيمتر.
2- تأمين الكمية الكافية من المواد: تتطلب الأبنية الضخمة كميات كبيرة من المواد الخام. ولكن، فإن تأمين هذه المواد ليس سهلاً، خاصة في الأماكن التي يعاني فيها النقل من الازدحام، فقد يتسبب ذلك في تباطؤ عملية البناء.
3- توفير المساحة الكافية: تتطلَّب الأبنية الضخمة مساحات كبيرة، وهذا التحدي يتزايد في المدن التي تعاني من ضيق الأرض والمساحة الخضراء.
4- البيئة والطقس: تتأثر الأبنية الضخمة بالظروف المناخية والطقسية، مما يتطلب تصميمها بطريقة تتناسب مع المناخ الذي توجد فيه.
5- الأمان والاستدامة: يجب أن يكون بناء الأبنية الضخمة مستدام وآمن، ويجب أن تراعى خصائص كسوة الواجهة وأسس البناء وما إلى ذلك لتوفير الأمان للسكان والعمال.