تواجه العلماء عدة تحديات في دراسة وتطوير التحليل الرياضي المركب، ومن أهم هذه التحديات:
1- الخوارزميات: تتطلب معظم التحليلات الرياضية المركبة استخدام خوارزميات معقدة ومتطورة، وهذا يعني أنه من الصعب تصميمها وتطويرها.
2- قياس الأداء: يواجه العلماء تحديًا في تطوير معايير لقياس أداء تحليلات الرياضية المركبة، حيث أن هذه التحليلات تتضمن عدة متغيرات، مما يجعل من الصعب قياس أدائها بشكل دقيق.
3- الحصول على البيانات: تحتاج التحليلات الرياضية المركبة إلى العديد من البيانات المختلفة والمتعلقة بمجال الدراسة، ويواجه العلماء تحديًا في جمع هذه البيانات بشكل دقيق وتحليلها بطريقة فعالة.
4- التحديث الدوري: يجب على العلماء الاستمرار في تطوير وتحديث التحليلات الرياضية المركبة بشكل دوري، وهذا يتطلب جهودًا مستمرة منهم في مجال البحث والتطوير.