تواجه الإدارة الوسطى في القطاع الخاص العديد من التحديات، من أهمها:
1- التغيير المستمر في البيئة العاملة والسوق.
2- عدم توافق وجهات النظر بين طبقات الموظفين العليا والوسطى والأسفل.
3- صعوبة تحديد وتنفيذ الاستراتيجيات والأهداف المؤسسية.
4- الضغط على الأداء وزيادة كفاءة الإنتاج.
5- صعوبة الحفاظ على الجودة المنتجة ورفعها في بعض الأوقات.
6- تحديد الميزانية المالية والتحكم فيها والحفاظ على توازنها.
7- تحقيق التوازن بين العمليات الداخلية والعلاقات الخارجية.