تواجه كينيا عدة تحديات في تنفيذ التزاماتها بموجب القانون الدولي لحقوق الإنسان، ومن أبرزها:
1- قضايا الفساد: تعاني كينيا من مشاكل الفساد وسوء الإدارة الحكومية والتي تؤثر سلبًا على حقوق الإنسان وتقييد الحريات العامة.
2- العنف والإرهاب: تعاني كينيا من خطر الهجمات الإرهابية والعنف المتزايد من قبل المتطرفين، الأمر الذي يؤثر على الحقوق الأساسية للمواطنين.
3- قضايا اللاجئين: تُعتبر كينيا مأوى للعديد من اللاجئين من دول الجوار، وتواجه التحديات المتعلقة بحماية حقوقهم وتوفير المساعدة الإنسانية في ظل ظروف صعبة.
4- التحيز القبلي والديني: تعاني كينيا من تحيز قوي وواسع للعرق والدين، وهو ما يؤثر على قدرة الحكومة على تنفيذ التزاماتها في المساواة وحقوق الإنسان.
5- نقص التمويل: يعاني النظام القضائي ومؤسسات حقوق الإنسان في كينيا من نقص في التمويل، مما يؤثر على قدرتهم على تنفيذ تزاماتهم في مجال حقوق الإنسان.