تعتمد التحاليل المخبرية المستخدمة في تشخيص الأمراض الجنسية على نوع الأمراض وعلى العينة المأخوذة من المريض، وتشمل:
1. تحاليل الدم: تستخدم للكشف عن الأجسام المضادة التي ينتجها جهاز المناعة لمكافحة العدوى، مثل التهاب الكبد الوبائي وفيروس الإيدز.
2. تحاليل البول: تستخدم للكشف عن وجود العدوى والتهابات في الجهاز البولي والتي يمكن أن تسبب الأمراض الجنسية.
3. التحاليل الجينية PCR: تستخدم للكشف عن الحمض النووي المرتبط بالعدوى، وتستخدم بشكل متزايد للكشف عن العدوى بفيروس الإيدز والكلاميديا والزهري.
4. التحاليل الحرارية : تستخدم للكشف عن الفطريات أو البكتيريا، وهي تحليل للعينات المأخوذة من الموجودات الجنسية ، وتستخدم عادة لتشخيص العدوى الفطرية مثل التهابات المهبل والأدوات التناسلية الأخرى.
5. الفحوصات السريرية : تستند على الفحص البدني للعلامات الظاهرة عند المريض، ويمكن أن تستخدم للكشف عن الأمراض الجنسية الموضعية.