هناك عدة إشكاليات تواجه الأدب الإلكتروني في البحث الأكاديمي، منها:
1. مصداقية المصادر: قد يكون من الصعب التحقق من مصداقية المصادر الإلكترونية، حيث يمكن لأي شخص نشر المعلومات على الإنترنت دون أي ضوابط. قد تحتوي بعض المواقع على معلومات غير صحيحة أو غير موثوقة.
2. ضياع التراث الثقافي: قد يسهم الاعتماد على الأدب الإلكتروني في ضياع التراث الثقافي، حيث يمكن أن يتم حذف أو تعديل المواد الإلكترونية بسهولة، مما يؤدي إلى فقدان المعلومات الهامة.
3. انخفاض جودة المحتوى: يمكن لأي شخص نشر المحتوى على الإنترنت دون ضوابط صارمة، مما يؤدي إلى وجود العديد من المواضيع ذات الجودة المنخفضة والمعلومات غير الدقيقة.
4. عدم الوصول للمصادر المدفوعة: قد تكون بعض المصادر الأكاديمية القيمة متاحة فقط بمقابل مادي، مما يعيق وصول الباحثين إلى هذه المعلومات.
5. الاعتماد المفرط على الأدوات التكنولوجية: بسبب التطور التكنولوجي، يعتمد الباحثون في كثير من الأحيان على الأدوات التكنولوجية في عمليات البحث والتحليل، وهذا قد يؤدي إلى الاعتماد الزائد على تلك الأدوات وتقليل العمل اليدوي والتفكير النقدي.