تتنوع الأدوات الطبية التي تستخدم في الكيمياء الطبية وتشمل:
1. المجهر: وهو يستخدم في تحليل العينات الدقيقة بالاستعانة بأساليب بصرية.
2. السيتروفوتومتر: وهو يُستخدم في تحليل العينات بإشعاع ضوئي وقياس التأثير الضوئي للعينة.
3. المطياف الجزيئي: وهو يستخدم لتحديد تركيز المواد الكيميائية المختلفة في العينات باستخدام الضوء.
4. الطيف النووي المغناطيسي: وهو يستخدم لتحليل العينات المركبة كالبروتينات والأحماض النووية.
5. جهاز التحليل الحيوي: وهو يستخدم في تحديد نوعية وكمية الجزيئات الحيوية الموجودة في العينة.
6. رقم الهيدروجين الأيوني: وهو يستخدم لقياس حموضة وقاعدية العينة.
7. مجسات الاختلاف الكهربائي: وهي تستخدم لقياس تغيرات الجهد والتيار الكهربائي الناتج عن التفاعلات الكيميائية في العينة.